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你真的會引用參考文獻(xiàn)嗎？Google一下，網(wǎng)上有大量的資源能幫助到你。但是大部分都側(cè)重于技術(shù)細(xì)節(jié)，例如使用的最佳參考文獻(xiàn)方式或教你如何使用文獻(xiàn)管理軟件。

然而，如何將參考文獻(xiàn)穿插到文章正文中，是否該引用或剔除某篇論文？引用一篇綜述還是引用一系列原創(chuàng)性論文？遇到和你的論點(diǎn)相矛盾的論文該如何處理？這些方面大家往往都缺乏指導(dǎo)。 ISE這篇博文在一定程度上能幫助到你。

2017年，我和同事在Scientific Reports上發(fā)表了一篇名為Dose-dependent behavioural fever responses in desert locusts challenged with the entomopathogenic fungus Metarhizium acridum的論文。

我們花了一年多的時間來撰寫這篇文章，投稿后，文章被該領(lǐng)域的一位大牛和另一位匿名審稿人進(jìn)行了同行評審。

今天，我將向讀者們介紹論文中每處文獻(xiàn)的引用，為什么選擇這些參考文獻(xiàn)。本次博文還將討論我們投稿后收到的一些與參考文獻(xiàn)相關(guān)的審稿意見，以及我們是如何處理它們的。

文章名：Dose-dependent behavioural fever responses in desert locusts challenged with the entomopathogenic fungus Metarhizium acridum

引言部分

Fever body temperatures are an adaptive response to infection in many species, and they can be achieved by physiological and/or behavioural means such as basking (Hart, 1988; Kluger et al., 1996).

這是一個非常寬泛的陳述，因此我們選擇引用一篇經(jīng)典的的綜述(Hart,1988)，它已經(jīng)被引用了1798次(根據(jù)Google Scholar，截止到2019年1月7日)，以及另一篇比較被認(rèn)可的綜述(Kluger et al ., 1996)，其中引用了許多不同物種的關(guān)鍵研究。通過引用這些參考文獻(xiàn)，我們不僅引導(dǎo)讀者閱讀了兩篇重要的文獻(xiàn)，也為本文的主題展開打下堅實(shí)基礎(chǔ)，而且我們也向該領(lǐng)域的兩位巨頭表示了致意，最后向?qū)徃迦苏故玖宋覀冊谠擃I(lǐng)域扎實(shí)的基礎(chǔ)知識。

Ectotherms rely exclusively on behavioural strategies to achieve fever, and these have been described across a diverse range of taxa including reptiles, amphibians, and insects (Kluger et al., 1996).

當(dāng)我們開始縮小話題范圍時，我們再次引用Kluger et al.(1996)。這是因為，Hart(1998)討論了許多不同的行為變化對感染的反應(yīng)，相反地，Kluger et al.(1996)只關(guān)注了發(fā)熱，并列出了不同動物發(fā)出指令的關(guān)鍵性研究，如前所述。

Behavioural fever can decrease mortality and morbidity in infected animals (Louis et al., 1986; Carruthers et al., 1992; Blanford and Thomas, 2001; Elliot et al., 2002).

在一系列分類群里有許多研究已經(jīng)證明了這一說法。然而，把這些研究的內(nèi)容都列出來是不實(shí)際的。因此，在這種情況下，我們選擇與我們的研究最密切相關(guān)的那些研究來證明（即這些研究都使用了直翅目(Order Orthoptera)的動物。）

This occurs because high body temperatures are suboptimal for pathogen growth (Inglis et al., 1996; Elliot et al., 2002) [1], and increase the mortality of some pathogens (Carruthers et al., 1992) [2]; high body temperatures also enhance several aspects of host immune function (Ouedraogo et al., 2003; Bolta?a et al., 2013). [3]

[1] 這兩篇文獻(xiàn)都支持這一說法，表明在高溫條件下，蚱蜢/蝗蟲的霉菌數(shù)量減少。有效引用參考文獻(xiàn)的一個關(guān)鍵因素是：簡明扼要地總結(jié)多篇文章的主要發(fā)現(xiàn)成果。在這種情況下，簡單的聲明 “This occurs because high body temperatures are suboptimal for pathogen growth”比列出具體結(jié)果好，

例如,“A low prevalence of Beauveria bassiana mycosis was observed in inoculated Melanoplus sanguinipes nymphs exposed to a continuous temperature of 35 and 40°C，whereas continuous exposure to 30°C did not have a significant effect on disease development”。

[2] 我們在回顧審稿人意見中加入了這項研究(見BOX 1)。在眾多的研究結(jié)果中，這篇文章顯示，發(fā)熱的溫度完全消除了透明翅蚱蜢(Camnula pellucida)身上的 Entomophaga grylli。要說明這一點(diǎn)非常重要，因為人們普遍認(rèn)為，直翅目(Order Orthoptera)不能通過 Metarhizium感染，因此這就是為什么我們說“某些病原體”。這是平衡的參考引用，即你需要提供會引起爭議的所有方面。

[3] 在關(guān)于這一主題的大多數(shù)文章中，Ouedraogo et al. (2003) 的文章被引用來支持這一觀點(diǎn)，因為這是第一次在宿主-病原體對發(fā)熱期間檢測先天免疫反應(yīng)，如血細(xì)胞動力學(xué)和吞噬作用。

當(dāng)你經(jīng)?？吹揭黄恼卤灰脮r，你很容易將其視為事實(shí)。

但是，請始終記住，繼續(xù)搜索某個領(lǐng)域的文獻(xiàn)來尋找新發(fā)現(xiàn)。會有新的研究結(jié)果支持你的論點(diǎn)，但也可能與你的論點(diǎn)相矛盾。Boltana et al.(2013)強(qiáng)烈支持Ouedraogo et al.(2003)的觀點(diǎn)。同樣，請注意我們會用簡單的方式總結(jié)這兩篇文章。

BOX 1.編輯部要求處理與參考文獻(xiàn)相關(guān)的評論和我們的回復(fù)。

在我們的原稿(同行評審之前)中，“…and increase the mortality of some pathogens (Carruthers et al.， 1992)……”這一條沒有包括在內(nèi)。

然后我們收到了一位審稿人的意見:

“L47-8 – fever may also be lethal to pathogens. If I am not mistaken, this is suggested in studies of Beauveria and E. grylli in locusts, perhaps Serratia too – earlier studies by Keith Charnley and Simon Blanford show clearing of infections I believe.”

正如你所看到的，審稿人似乎是憑記憶提出一個觀點(diǎn)，他并不確定論證這一觀點(diǎn)的確切文獻(xiàn)。經(jīng)過徹底的文獻(xiàn)篩查后，我們相信已經(jīng)找到了審稿人提到的這項研究，我們的回應(yīng)如下:

“The idea that high temperatures kill pathogens is certainly true. The best evidence we’ve found that naturally selected temperatures can do this is for the effect of normal thermoregulatory behaviour in grasshoppers on E. grylli. Therefore, we’ve re-phrased our text to include this concept and the supporting reference (L47-51). We are not aware of any evidence for fever clearing infections in the Metarhizium/locust system [hence, we write “…of some pathogens”]

如果您在處理其他常見審稿人意見時需要幫助，請參考如何回復(fù)審稿人意見(點(diǎn)擊可閱讀）

Despite their benefit for fighting infection, fever body temperatures are also costly (Casadevall, 2016).

這也是一個非常寬泛的陳述，并且考慮到它與醫(yī)學(xué)領(lǐng)域相關(guān)，我們可以參考引用很多文章。我們之所以選擇了Casadevall(2016)，因為這是一篇“關(guān)于跨越病原體領(lǐng)域主題的簡明、實(shí)用和具有教育意義上的見解”，極富價值。它總結(jié)并結(jié)合了迄今為止富有爭議的背景。文章的作者是行業(yè)內(nèi)一位杰出的教授，在該領(lǐng)域發(fā)表了許多論文并被多次引用。我不是建議你引用一篇基于作者名望的文章；作者自己應(yīng)該批判性地評估每一篇被引用文章的價值。

Elevated body temperatures have been associated with increased metabolic rate (Muchlinski, 1985; Sherman and Stephens, 1998) [1], reduced growth rates (Boorstein and Ewald, 1987) [2], as well as defects in egg development (Anderson et al., 2013) [3].

[1]在以一個寬泛的陳述開始這一段后，我們緊接著列出支持該陳述的原創(chuàng)性研究論文。你會注意到這些文章相對較舊。然而，它們都從“發(fā)熱的代價”的角度明確地證實(shí)了這一說法，就像我們的文章一樣。你可以會說不應(yīng)引用發(fā)表時間超過5 - 6年的文章。

然而，靈活地處理這些規(guī)則會更好。例如，在引入某一個主題時，完全可以引用較早的突破性作品，并且這些規(guī)則在各個學(xué)科領(lǐng)域中不具備普遍性，例如，快速發(fā)展的領(lǐng)域(例如醫(yī)學(xué)科學(xué))比緩慢發(fā)展的領(lǐng)域(例如數(shù)學(xué))具有更高的周轉(zhuǎn)率。

[2]同樣，這篇文章比較老。然而，它再次從“發(fā)熱的代價”的角度證明了這一說法，并被引用了133次（根據(jù)Google Scholar，截止到2019年1月30日）。這也是一個不錯的研究，因為它的敘述是清晰的，這也影響了這篇文章的寫作風(fēng)格，即如何將發(fā)現(xiàn)作為一個故事呈現(xiàn)。

[3]這是一篇相對較新的論文。請注意，我們是如何將所有五篇文章交織成一個簡潔連貫的陳述的。

我們在每個特定陳述后直接添加了適當(dāng)?shù)囊?。不建議像下面的這種寫作和引用風(fēng)格：

Elevated body temperatures have been associated with increased metabolic rate, reduced growth rates, as well as defects in egg development (Muchlinski, 1985; Sherman and Stephens, 1998; Boorstein and Ewald, 1987; Anderson et al., 2013).

Furthermore, basking to achieve fever body temperatures confers additional costs in terms of missed feeding and mating opportunities, and increased predation risk (Otti et al., 2012).

為了進(jìn)一步支持我們的論點(diǎn)，我們引用了一項相對比較新的研究，該研究從另一個不同角度支持我們的論點(diǎn)。

These costs accrue quickly as body temperature rises, such that the temperature-fitness curves of healthy animals are often asymmetrical, with fitness declining more steeply with increasing temperature than with decreasing temperature (Martin and Heuy, 2008).

這篇文獻(xiàn)會給審稿人一個印象：即作者的專業(yè)涉獵不僅僅只局限于本行業(yè)內(nèi)，而且也關(guān)注特定主題以外的內(nèi)容。我們已經(jīng)提供了足夠的論據(jù)來證明論點(diǎn)。有了這篇高被引參考文獻(xiàn)，可以更加有利地支持我們的論點(diǎn)。

Sick individuals likely face a similar requirement to balance costs and benefits and avoid excessively high fever body temperatures, especially since behavioural fever responses are often unable to fully clear infection (Elliot et al., 2002; Ouedraogo et al., 2004) (but see Carruthers et al., 1992).

如上所述，我們爭論的一個方面是動物是否可以通過發(fā)熱完全清除感染（見Box 1）。我們和Elliot et al.(2002)以及Ouedraogo et al.(2004) ，都沒有找到證據(jù)表明蝗蟲可以擺脫Metharizium的感染；隨后，我們引用了Carruthers et al. (1992)的文章，該文章表明，發(fā)熱完全消滅了來自明目草蝗蟲(Camnula pellucida)身上的Entomophaga grylli。請注意我們處理這篇和我們論點(diǎn)相矛盾文章的簡單方法，即參見(Carruthers et al., 1992)。 通常，這就是提出平衡論證所必需的（或解決審稿人意見）。

In these cases, fever body temperatures might be expected to be modulated according to the severity or type of infection (Gardner and Thomas, 2002).

我們在寫作階段發(fā)現(xiàn)這篇文獻(xiàn)。換句話說，之前我們已經(jīng)闡釋并證明了我們的假設(shè)。然而，據(jù)我們所知，這篇文章是第一個直接提出我們在這篇文章中所需論證需要測試檢驗的假設(shè)，因此我們適當(dāng)?shù)匾昧怂?。這也提醒讀者，在投稿前，對每個陳述都需要進(jìn)行文獻(xiàn)檢索的重要性，確保該致謝的文獻(xiàn)都被引用。

In support of the adaptive deployment of fever responses, the occurrence and magnitude of behavioural fever are known to vary within and between insect species (Stahlschmidt and Adamo, 2013).

我們用另外一個比較寬泛的聲明來開始這一段，引用了一篇閆行為發(fā)熱的薈萃分析文獻(xiàn)。 使用薈萃分析文章可以一次總結(jié)多篇文章，從而作為宏觀的結(jié)論。

Crickets, Acheta domesticus, elicited behavioural fever responses when infected with thermo-susceptible parasites (e.g. Rickettsiella grylli), but not thermotolerant ones (e.g. Serratia marcescens, and the parasitoid fly Ormia ochracea) (Adamo, 1998).

除了論證我們的觀點(diǎn)，通過引用另外一篇文獻(xiàn)，我們可以幫助讀者了解我們所說的不同的發(fā)熱反應(yīng)是什么意思。

House flies, Musca domestica, infected with a higher dose of the fungus Beauveria bassiana exhibited higher-intensity fever responses than flies infected with a lower dose, putatively limiting fever costs (Anderson et al., 2013).

這是一篇來自該領(lǐng)域高手的優(yōu)秀文章，也是本研究的靈感來源。我們在整篇論文中都會引用這篇文章的內(nèi)容，是因為它與我們的文章聯(lián)系最緊密。我們在這里引用它，縮小了本文的具體研究目標(biāo)。

The physiological fevers of humans may also vary in magnitude according to the severity of infection (Kluger et al., 1996).

當(dāng)我們從人類健康的角度探討發(fā)熱領(lǐng)域時，我們可以引用許多文獻(xiàn)來支持這一說法，但是，我們認(rèn)為最好再次引用Kluger et al.(1996)，因為讀者在其中可以了解到關(guān)于該主題的最重要的基礎(chǔ)文章細(xì)節(jié)。

Thus, the adaptive deployment of fever may be a widespread phenomenon.

請注意，我們沒有引用與此陳述相關(guān)的任何文章。雖然有很多關(guān)于發(fā)熱的成本和益處的文章，但很少有文章研究過發(fā)熱的適應(yīng)性部署。在本研究中我們假設(shè)這種現(xiàn)象可能比原先認(rèn)為的更普遍。

In this study, we investigate whether desert locust, Schistocerca gregaria, behavioural fever responses differ in intensity according to the severity of Metarhizium acridum infection.

Metarhizium acridum is a specialist pathogen of locusts and grasshoppers and the basis of commercial biopesticides used for their control (Lomer et al., 2001).

這篇綜述（根據(jù)Google Scholar，截止到2019年1月15日，它被引用了468次）為讀者評估本研究成果的應(yīng)用提供了資料來源。

Whilst numerous laboratory and field trials have demonstrated the efficacy of these biopesticides, the speed of kill following application is highly variable (see van der Valk, 2007, and references therein).

這是一份來自聯(lián)合國的技術(shù)報告，描述了在非洲進(jìn)行的各種M. acridum-applied田間試驗。這是一個很好的資源，把迄今為止所討論的所有實(shí)驗室研究結(jié)果都放在蝗蟲生物防治的背景下。

The prevailing theory is that environmental temperature leads to this variability, by allowing or preventing effective behavioural fever responses (Elliot et al., 2002).

這是我們第四次引用這篇文章。雖然(Elliot et al., 2002)的研究并不是第一個提出這一理論的，但它是第一個明確表現(xiàn)出發(fā)熱的適應(yīng)性價值研究，因此它被認(rèn)為是關(guān)于這個課題的一篇突破性文章。

Thus, additional knowledge of locust behavioural fever responses to Metarhizium infection may also help inform the application of biopesticides for locust control.

第一部分的要點(diǎn)（引言）

· 每項陳述至少有一篇論文支持（除目標(biāo)和最初假設(shè)外）。

·需要廣泛閱讀并嚴(yán)格評估每篇文章，僅僅限于高質(zhì)量的文章。

·需要開始對每個段落都進(jìn)行廣泛的閱讀，然后引用特定的原創(chuàng)性研究論文，縮小觀點(diǎn)范圍。

·可以適當(dāng)引用任何與作者觀點(diǎn)相矛盾的文章。

·在句子中的每個特定陳述后可以直接放置適當(dāng)?shù)囊?，而不是僅僅組合在一起。

·引用了該領(lǐng)域的所有（過去和現(xiàn)在）大牛文章。

·對于那些寬泛的陳述，選擇引用與作者論文最相似的文章。

·在論文提交之前對每個陳述都進(jìn)行了文獻(xiàn)檢索，以方便查找最近的文章是否支持/反駁發(fā)現(xiàn)成果。

·對于介紹性陳述，簡要地將多篇文章的主要發(fā)現(xiàn)總結(jié)概括為一個連貫的整體。