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擴(kuò)張型心肌病(Dilated cardiomyopathy, DCM)是一種以左心室不明原因的擴(kuò)張和收縮功能障礙為特征的非缺血性心臟病，在全球范圍內(nèi)仍有較高的發(fā)病率與死亡率。雖然既往研究發(fā)現(xiàn)多種遺傳或后天因素會影響DCM的發(fā)生發(fā)展，但該疾病的確切病理機(jī)制仍不清楚，需要更多的研究進(jìn)行進(jìn)一步的探討。近年來，微陣列和高通量測序技術(shù)的生物信息學(xué)分析已被廣泛用于探索疾病相關(guān)的基因、生物過程和生物標(biāo)志物，這也為全面了解DCM的發(fā)病機(jī)制提供了更有價值的手段。

近期，重慶醫(yī)科大學(xué)附屬第二醫(yī)院佘強(qiáng)教授團(tuán)隊(duì)在CVIA雜志發(fā)表一篇題為《Identifying Key Genes and related molecules as potential biomarkers in Human Dilated Cardiomyopathy by Comprehensive Bioinformatics Analysis》的原創(chuàng)研究論文。

該研究采用大樣本量的高通量測序和微陣列譜數(shù)據(jù)來篩選DCM合并心力衰竭患者的關(guān)鍵致病基因，并對其富集信號通路和小分子化合物進(jìn)行了預(yù)測。

通過加權(quán)基因共表達(dá)網(wǎng)絡(luò)分析(Weighted Gene Co-Expression Network Construction, WGCNA)、差異基因以及PPI分析，研究發(fā)現(xiàn)COL3A1、COL1A2、LUM和THBS4在DCM合并心力衰竭患者的心臟標(biāo)本中高表達(dá)并且可能發(fā)揮關(guān)鍵致病作用，進(jìn)一步的LASSO回歸模型提示了4個hub基因作為DCM生物標(biāo)志物的可能性。此外，基因富集分析（Gene Set Enrichment Analysis, GSEA）提示4個基因在纖維化通路中顯著富集，包括細(xì)胞外基質(zhì)通路、TGF-β通路以及細(xì)胞粘著斑通路。研究還發(fā)現(xiàn)3個miRNA（hsa-let-7b-5p、hsa-let-7c-5p和hsa-miR-29b-3p）和30個環(huán)狀RNA（GIT2_hsa_circRNA10114、ANKRD52_hsa_circRNA9983、JARID2_hsa_circRNA6618等）與DCM相關(guān)。

本研究結(jié)果表明，4個hub基因均與DCM的發(fā)生發(fā)展有顯著的相關(guān)性。雖然既往相關(guān)研究也提示了這4個基因與DCM的可能聯(lián)系，但并未強(qiáng)調(diào)其在DCM中的重要性。本研究使用大樣本量的數(shù)據(jù)集進(jìn)行分析（共納入252例DCM患者和182例健康供體進(jìn)行分析），并應(yīng)用多種生物信息學(xué)分析方法共同篩選，最后篩選出的4個hub基因在另一個大樣本量數(shù)據(jù)集中進(jìn)行驗(yàn)證（37例DCM患者和14例健康供體），發(fā)現(xiàn)COL3A1、COL1A2、LUM和THBS4在DCM可能發(fā)揮重要作用。本研究的結(jié)果對于DCM的后續(xù)實(shí)驗(yàn)研究具有一定參考價值，但仍存在一定局限性，4個hub基因在DCM中扮演的具體角色仍需進(jìn)一步的挖掘。

通訊作者簡介：

佘強(qiáng)

佘強(qiáng)，醫(yī)學(xué)博士，主任醫(yī)師，二級教授，博士研究生導(dǎo)師，重慶英才名師名家，重慶市學(xué)術(shù)技術(shù)帶頭人，重慶市心血管內(nèi)科研究生導(dǎo)師團(tuán)隊(duì)帶頭人。中華醫(yī)學(xué)會心血管病分會精準(zhǔn)心血管病學(xué)學(xué)組委員，中國醫(yī)師協(xié)會中西醫(yī)結(jié)合醫(yī)師分會心血管病學(xué)專委會委員，中國老年醫(yī)學(xué)學(xué)會心血管病分會委員，重慶市中西醫(yī)結(jié)合學(xué)會高血壓專委會主任委員，重慶市醫(yī)學(xué)會心血管病專委會冠心病學(xué)組組長，衛(wèi)生部心血管疾病介入診療（冠心病和心律失常）培訓(xùn)基地導(dǎo)師。曾在德國科隆大學(xué)醫(yī)院心臟中心留學(xué)。承擔(dān)國家級及省部級課題10余項(xiàng)，發(fā)表學(xué)術(shù)論文100余篇，其中SCI期刊發(fā)表50余篇。

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https://www.scienceopen.com/hosted-document?doi=10.15212/CVIA.2023.0018

關(guān)于 CVIA

Cardiovascular Innovations and Applications（CVIA）期刊是長城國際心臟病學(xué)大會（長城會）的官方期刊。自2015年創(chuàng)刊以來，CVIA已連續(xù)出版7卷，每篇文章都凝聚著全球心血管專家的智慧結(jié)晶。CVIA期刊由首都醫(yī)科大學(xué)附屬北京安貞醫(yī)院、鄭州大學(xué)第一附屬醫(yī)院心血管病醫(yī)院董建增教授和佛羅里達(dá)大學(xué)健康學(xué)院的Jamie Beth Conti教授擔(dān)任共同主編，由來自愛爾蘭的Compuscript公司負(fù)責(zé)出版工作。

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